產生的主要原因有以下三個方面：

　　1）蝦苗蝦肝腸胞蟲感染率低，采樣時未能采集到陽性個體，蝦苗檢測結果表現為陰性。檢測結果為陰性，其實有兩種可能，一種是樣品所在蝦池所有蝦苗個體都不攜帶蝦肝腸胞蟲，二是該池塘中存在蝦肝腸胞蟲，但攜帶率低，采樣時沒有采到陽性樣，樣品全為陰性個體。一只蝦池中數量達到百萬只，采樣只能采集其中極少部分，如果陽性個體含量較低，能采集到陽性個體的機率極低。因此，檢測結果為陰性卻為蝦肝腸胞蟲含量低的苗種投放后，因為環境條件不佳會出現蝦肝腸胞蟲的暴發。這幾年業內已充分認識到蝦肝腸胞蟲的危害，從種蝦場到繁育場再到標粗場都十分重視種蝦或蝦苗的蝦肝腸胞蟲的控制，應該說種蝦或蝦苗中蝦肝腸胞蟲不象前幾年那樣含量高，但要做到每只種蝦或每只蝦苗都不帶蟲仍有一定難度，因此，攜帶低含量蝦肝腸胞蟲的苗是養殖一段時間后出現蝦肝腸胞蟲陽性蝦苗的主要原因。

　　2）如果池塘滅胞不*，即使蝦苗個體表現為絕對不攜帶蝦肝腸胞蟲，但養殖一段時間后也還可能檢測出陽性。如果蝦池環境中存在上批養殖殘留的蝦肝腸胞蟲，再次投苗后，前期因為水質尚可，對蝦具備一定的抵抗能力，不一定感染蝦肝腸胞蟲。隨著養殖時間的發展，水質逐漸惡化，對蝦的抵抗力下降，此時池塘中存在的少量蝦肝腸胞蟲可能感染發病，感染的數量增多，從而表現為蝦肝腸胞蟲陽性結果。

　　3）檢測結果不可靠。如果檢測機構因為設備、人員、方法、環境、試劑以及管理體系等方面不符合條件的原因，可能會將陽性樣品檢測出陰性結果出來，也可能出現上述現象。如果是這樣，那就要從上述方面來考察檢測機構是否做到質量可靠。

　　蝦苗的檢測工作大大提高了投放蝦苗的質量，這是近年來如東小棚成功的主要原因之一，也被廣大養殖戶充分認識。但并不是檢測為陰性的苗種一定能養殖成功，這其中就包括有上述采樣技術的漏洞。目前這種漏洞還較難通過更可靠的手段來改善。廣大養殖戶可以通過多樣本檢測來降低這種風險。